Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPTQ96BT3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPTQ96BT3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPTQ96BT3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPTQ96BT3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPTQ96BT3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPTQ96BT3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPTQ96BT3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPTQ96BT3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPTQ96BT3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPTQ96BT3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPTQ96BT3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPTQ96BT3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPTQ96BT3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPTQ96BT3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPTQ96BT3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPTQ96BT3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPTQ96BT3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPTQ96BT3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPTQ96BT3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPTQ96BT3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPTQ96BT3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPTQ96BT3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPTQ96BT3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms