Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC47Q96A33 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC47Q96A33 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC47Q96A33 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms