Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PRG4Q92954 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PRG4Q92954 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PRG4Q92954 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
PRG4Q92954 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
PRG4Q92954 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PRG4Q92954 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PRG4Q92954 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PRG4Q92954 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PRG4Q92954 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
PRG4Q92954 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
PRG4Q92954 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PRG4Q92954 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
PRG4Q92954 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
PRG4Q92954 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PRG4Q92954 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PRG4Q92954 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
PRG4Q92954 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
PRG4Q92954 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PRG4Q92954 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
PRG4Q92954 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
PRG4Q92954 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
PRG4Q92954 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
PRG4Q92954 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PRG4Q92954 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PRG4Q92954 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PRG4Q92954 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PRG4Q92954 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PRG4Q92954 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
PRG4Q92954 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
PRG4Q92954 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
PRG4Q92954 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
PRG4Q92954 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
PRG4Q92954 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
PRG4Q92954 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
PRG4Q92954 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC38.93■■■■□ 3.82
PRG4Q92954 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
PRG4Q92954 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PRG4Q92954 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
PRG4Q92954 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
PRG4Q92954 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PRG4Q92954 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PRG4Q92954 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PRG4Q92954 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
PRG4Q92954 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
PRG4Q92954 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
PRG4Q92954 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms