Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BAP1Q92560 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BAP1Q92560 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms