Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG4AQ8WYN0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG4AQ8WYN0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4AQ8WYN0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms