Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA2

PATE1, Prostate and testis expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATE1Q8WXA2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PATE1Q8WXA2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATE1Q8WXA2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms