Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC107Q8WV48 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC107Q8WV48 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms