Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
RB1CC1Q8TDY2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC47.34■■■■■ 5.17
RB1CC1Q8TDY2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC47.34■■■■■ 5.17
RB1CC1Q8TDY2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
RB1CC1Q8TDY2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC47.34■■■■■ 5.17
RB1CC1Q8TDY2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC47.33■■■■■ 5.17
RB1CC1Q8TDY2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC47.33■■■■■ 5.17
RB1CC1Q8TDY2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
RB1CC1Q8TDY2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
RB1CC1Q8TDY2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC47.32■■■■■ 5.17
RB1CC1Q8TDY2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
RB1CC1Q8TDY2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
RB1CC1Q8TDY2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC47.31■■■■■ 5.16
RB1CC1Q8TDY2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC47.31■■■■■ 5.16
RB1CC1Q8TDY2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC47.29■■■■■ 5.16
RB1CC1Q8TDY2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
RB1CC1Q8TDY2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC47.29■■■■■ 5.16
RB1CC1Q8TDY2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC47.29■■■■■ 5.16
RB1CC1Q8TDY2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
RB1CC1Q8TDY2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC47.28■■■■■ 5.16
RB1CC1Q8TDY2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC47.28■■■■■ 5.16
RB1CC1Q8TDY2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC47.27■■■■■ 5.16
RB1CC1Q8TDY2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC47.27■■■■■ 5.16
RB1CC1Q8TDY2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.26■■■■■ 5.16
RB1CC1Q8TDY2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
RB1CC1Q8TDY2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
RB1CC1Q8TDY2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC47.25■■■■■ 5.16
RB1CC1Q8TDY2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC47.25■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC47.25■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC47.24■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC47.24■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC47.24■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC47.24■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.23■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC47.23■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC47.23■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC47.21■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC47.21■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC47.21■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC47.21■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC47.2■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC47.2■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.2■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.15
RB1CC1Q8TDY2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC47.19■■■■■ 5.14
RB1CC1Q8TDY2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
RB1CC1Q8TDY2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC47.18■■■■■ 5.14
RB1CC1Q8TDY2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
RB1CC1Q8TDY2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
RB1CC1Q8TDY2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
RB1CC1Q8TDY2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC47.17■■■■■ 5.14
RB1CC1Q8TDY2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.17■■■■■ 5.14
RB1CC1Q8TDY2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
RB1CC1Q8TDY2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC47.16■■■■■ 5.14
RB1CC1Q8TDY2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
RB1CC1Q8TDY2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
RB1CC1Q8TDY2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
RB1CC1Q8TDY2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
RB1CC1Q8TDY2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC47.15■■■■■ 5.14
RB1CC1Q8TDY2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC47.14■■■■■ 5.14
RB1CC1Q8TDY2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
RB1CC1Q8TDY2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.14■■■■■ 5.14
RB1CC1Q8TDY2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC47.14■■■■■ 5.14
RB1CC1Q8TDY2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC47.13■■■■■ 5.13
RB1CC1Q8TDY2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC47.12■■■■■ 5.13
RB1CC1Q8TDY2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.12■■■■■ 5.13
RB1CC1Q8TDY2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC47.11■■■■■ 5.13
RB1CC1Q8TDY2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
RB1CC1Q8TDY2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC47.11■■■■■ 5.13
RB1CC1Q8TDY2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
RB1CC1Q8TDY2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC47.1■■■■■ 5.13
RB1CC1Q8TDY2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC47.1■■■■■ 5.13
RB1CC1Q8TDY2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
RB1CC1Q8TDY2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC47.09■■■■■ 5.13
RB1CC1Q8TDY2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
RB1CC1Q8TDY2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
RB1CC1Q8TDY2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC47.08■■■■■ 5.13
RB1CC1Q8TDY2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC47.08■■■■■ 5.13
RB1CC1Q8TDY2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
RB1CC1Q8TDY2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC47.08■■■■■ 5.13
RB1CC1Q8TDY2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
RB1CC1Q8TDY2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC47.07■■■■■ 5.12
RB1CC1Q8TDY2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
RB1CC1Q8TDY2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
RB1CC1Q8TDY2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
RB1CC1Q8TDY2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.05■■■■■ 5.12
RB1CC1Q8TDY2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC47.05■■■■■ 5.12
RB1CC1Q8TDY2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
RB1CC1Q8TDY2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC47.04■■■■■ 5.12
RB1CC1Q8TDY2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
RB1CC1Q8TDY2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47.04■■■■■ 5.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms