Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB3IL1Q8TBN0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB3IL1Q8TBN0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB3IL1Q8TBN0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3IL1Q8TBN0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms