Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP9

ZNF555, Zinc finger protein 555, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF555Q8NEP9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF555Q8NEP9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF555Q8NEP9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms