Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAAF3Q8N9W5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAAF3Q8N9W5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF3Q8N9W5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms