Protein–RNA interactions for Protein: Q8N695

SLC5A8, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A8Q8N695 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A8Q8N695 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC5A8Q8N695 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A8Q8N695 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A8Q8N695 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A8Q8N695 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A8Q8N695 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A8Q8N695 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A8Q8N695 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A8Q8N695 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A8Q8N695 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A8Q8N695 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms