Protein–RNA interactions for Protein: Q8N187

CARF, Calcium-responsive transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARFQ8N187 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CARFQ8N187 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARFQ8N187 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms