Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMEM179Q6ZVK1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM179Q6ZVK1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM179Q6ZVK1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms