Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZST2

ZCCHC23, Zinc finger CCHC domain-containing protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC23Q6ZST2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC23Q6ZST2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC23Q6ZST2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC23Q6ZST2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC23Q6ZST2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC23Q6ZST2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC23Q6ZST2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC23Q6ZST2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC23Q6ZST2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC23Q6ZST2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC23Q6ZST2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC23Q6ZST2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC23Q6ZST2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC23Q6ZST2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZCCHC23Q6ZST2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZCCHC23Q6ZST2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZCCHC23Q6ZST2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC23Q6ZST2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms