Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSG1

RNF165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF165Q6ZSG1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF165Q6ZSG1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RNF165Q6ZSG1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF165Q6ZSG1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms