Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GBP6Q6ZN66 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GBP6Q6ZN66 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBP6Q6ZN66 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP6Q6ZN66 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms