Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC36A4Q6YBV0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC36A4Q6YBV0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC36A4Q6YBV0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms