Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE3

CLPSL2, Colipase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSL2Q6UWE3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLPSL2Q6UWE3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 530.3 ms