Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC137Q6PK04 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC137Q6PK04 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC137Q6PK04 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms