Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S1

DENND1B, DENN domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1BQ6P3S1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND1BQ6P3S1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DENND1BQ6P3S1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DENND1BQ6P3S1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms