Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.593e-6■■■■□ 23.1
NIPBLQ6KC79 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.83e-6■■■■□ 23.1
NIPBLQ6KC79 RPL4-207ENST00000564647 1110 ntTSL 24.13□□□□□ -1.754e-17■■■■□ 23.1
NIPBLQ6KC79 SNHG1-203ENST00000537024 532 ntTSL 54.02□□□□□ -1.779e-27■■■■□ 23
NIPBLQ6KC79 HSPA8-222ENST00000534319 1884 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.891e-29■■■■□ 23
NIPBLQ6KC79 HSPA8-203ENST00000524552 963 ntTSL 1 (best)9.23□□□□□ -0.931e-29■■■■□ 23
NIPBLQ6KC79 HSPA8-215ENST00000532091 2301 ntTSL 56.66□□□□□ -1.341e-29■■■■□ 23
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NIPBLQ6KC79 USP1-204ENST00000452143 893 ntTSL 310.13□□□□□ -0.791e-6■■■■□ 23
NIPBLQ6KC79 USP1-201ENST00000339950 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.991e-6■■■■□ 23
NIPBLQ6KC79 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.421e-6■■■■□ 23
NIPBLQ6KC79 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.223e-6■■■■□ 23
NIPBLQ6KC79 NUP210-202ENST00000420141 3134 ntTSL 1 (best)17.18■□□□□ 0.342e-6■■■■□ 22.8
NIPBLQ6KC79 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.51■■□□□ 1.352e-77■■■■□ 22.8
NIPBLQ6KC79 DANCR-203ENST00000441504 336 ntTSL 215.56■□□□□ 0.082e-77■■■■□ 22.8
NIPBLQ6KC79 HK1-209ENST00000470050 314 ntTSL 514.68□□□□□ -0.067e-7■■■■□ 22.7
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NIPBLQ6KC79 KMT2C-212ENST00000558084 16862 ntTSL 1 (best)4.11□□□□□ -1.753e-6■■■■□ 22.6
NIPBLQ6KC79 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.753e-6■■■■□ 22.6
NIPBLQ6KC79 KMT2C-208ENST00000473186 12854 ntTSL 1 (best)2.65□□□□□ -1.993e-6■■■■□ 22.6
NIPBLQ6KC79 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.479e-7■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 ZNF117-202ENST00000487644 1837 ntTSL 25.02□□□□□ -1.619e-7■■■■□ 22.5
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NIPBLQ6KC79 CTBP2-208ENST00000476817 705 ntTSL 318.39■□□□□ 0.536e-7■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.356e-7■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 AC087633.2-203ENST00000618377 489 ntTSL 516.08■□□□□ 0.161e-7■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.041e-7■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.093e-7■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.156e-7■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.226e-7■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 NFE4-201ENST00000420058 1072 ntTSL 1 (best)13.66□□□□□ -0.226e-6■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 ATP6V0A1-207ENST00000585828 2139 ntTSL 1 (best)11.19□□□□□ -0.621e-7■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 CTBP2-212ENST00000530884 578 ntTSL 310.58□□□□□ -0.726e-7■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 ATP6V0A1-214ENST00000587797 1878 ntTSL 210.4□□□□□ -0.741e-7■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 SCLT1-202ENST00000439369 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.833e-7■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 NFE4-202ENST00000638942 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.856e-6■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 CTBP2-213ENST00000530930 425 ntTSL 59.18□□□□□ -0.946e-7■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 ATP6V0A1-205ENST00000544137 3047 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.071e-7■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 SCLT1-201ENST00000281142 3055 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.093e-7■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 CTBP2-203ENST00000337195 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.226e-7■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 ATP6V0A1-202ENST00000343619 4128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.231e-7■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 ATP6V0A1-201ENST00000264649 4110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.291e-7■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 ATP6V0A1-225ENST00000592831 4652 nt6.44□□□□□ -1.381e-7■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 AC087633.2-206ENST00000614581 513 ntTSL 56.32□□□□□ -1.41e-7■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 ADAMTS3-201ENST00000286657 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.581e-7■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 ADAMTS3-202ENST00000505193 1002 ntTSL 25.07□□□□□ -1.61e-7■■■■□ 22.5
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NIPBLQ6KC79 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.731e-7■■■■□ 22.5
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NIPBLQ6KC79 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.153e-6■■■■□ 22.5
NIPBLQ6KC79 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.599e-27■■■■□ 22.5
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NIPBLQ6KC79 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.762e-6■■■■□ 22.4
NIPBLQ6KC79 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.892e-6■■■■□ 22.4
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NIPBLQ6KC79 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.472e-6■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.244e-8■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.231e-5■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.661e-5■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.575e-6■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 ABHD5-207ENST00000486764 618 ntTSL 218.2■□□□□ 0.51e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.441e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.431e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 PNCK-208ENST00000422811 771 ntTSL 317.64■□□□□ 0.415e-6■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 ASNS-204ENST00000414884 584 ntTSL 217.34■□□□□ 0.371e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.351e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 ASNS-211ENST00000451771 562 ntTSL 217.15■□□□□ 0.341e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.295e-6■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 PLD3-224ENST00000602131 503 ntTSL 216.63■□□□□ 0.251e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 NMRAL1-203ENST00000571291 927 ntTSL 316.6■□□□□ 0.251e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.251e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.241e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.224e-8■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.221e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.214e-8■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 WDFY3-208ENST00000509172 453 ntTSL 316.34■□□□□ 0.211e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 GORASP2-204ENST00000454751 624 ntTSL 516.23■□□□□ 0.191e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 PNCK-221ENST00000466074 1564 ntTSL 216.13■□□□□ 0.175e-6■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 PLD3-215ENST00000493006 694 ntTSL 216.03■□□□□ 0.161e-5■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.151e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 TMEM164-207ENST00000471255 418 ntTSL 315.83■□□□□ 0.121e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.122e-10■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 AC004890.2-203ENST00000481817 943 ntTSL 215.77■□□□□ 0.121e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 UBA1-208ENST00000457753 809 ntTSL 515.73■□□□□ 0.114e-8■■■■□ 22.3
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