RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420058.1

NFE4-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NFE4, Length 1,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE4-201ENST00000420058 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.24■■■■□ 3.39
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NFE4-201ENST00000420058 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.33■■■□□ 2.61
NFE4-201ENST00000420058 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.11■■■□□ 2.57
NFE4-201ENST00000420058 NACADO15069 1562 aa30.87■■■□□ 2.53
NFE4-201ENST00000420058 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.73■■■□□ 2.51
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NFE4-201ENST00000420058 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.39■■■□□ 2.46
NFE4-201ENST00000420058 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.34■■■□□ 2.45
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NFE4-201ENST00000420058 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.68■■■□□ 2.34
NFE4-201ENST00000420058 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.67■■■□□ 2.34
NFE4-201ENST00000420058 SCRIBQ14160 1630 aa29.65■■■□□ 2.34
NFE4-201ENST00000420058 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
NFE4-201ENST00000420058 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.89■■■□□ 2.22
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NFE4-201ENST00000420058 CUX2O14529 1486 aa28.43■■■□□ 2.14
NFE4-201ENST00000420058 ERCC6Q03468 1493 aa28.34■■■□□ 2.13
NFE4-201ENST00000420058 SMARCA4P51532 1647 aa28.28■■■□□ 2.12
NFE4-201ENST00000420058 SMARCA2P51531 1590 aa28.26■■■□□ 2.11
NFE4-201ENST00000420058 HMGXB3Q12766 1538 aa28.26■■■□□ 2.11
NFE4-201ENST00000420058 NESP48681 1621 aa28.23■■■□□ 2.11
NFE4-201ENST00000420058 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
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NFE4-201ENST00000420058 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.95■■■□□ 2.07
NFE4-201ENST00000420058 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
NFE4-201ENST00000420058 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.88■■■□□ 2.05
NFE4-201ENST00000420058 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.77■■■□□ 2.04
NFE4-201ENST00000420058 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.73■■■□□ 2.03
NFE4-201ENST00000420058 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.72■■■□□ 2.03
NFE4-201ENST00000420058 WIZO95785 1651 aa27.54■■■□□ 2
NFE4-201ENST00000420058 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.54■■■□□ 2
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NFE4-201ENST00000420058 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.35■■□□□ 1.97
NFE4-201ENST00000420058 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.34■■□□□ 1.97
NFE4-201ENST00000420058 CFTRP13569 1480 aa27.32■■□□□ 1.96
NFE4-201ENST00000420058 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
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NFE4-201ENST00000420058 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
NFE4-201ENST00000420058 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.93■■□□□ 1.9
NFE4-201ENST00000420058 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
NFE4-201ENST00000420058 IFT140Q96RY7 1462 aa26.85■■□□□ 1.89
NFE4-201ENST00000420058 PRDM2Q13029 1718 aa26.82■■□□□ 1.88
NFE4-201ENST00000420058 TOPBP1Q92547 1522 aa26.8■■□□□ 1.88
NFE4-201ENST00000420058 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.76■■□□□ 1.87
NFE4-201ENST00000420058 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.76■■□□□ 1.87
NFE4-201ENST00000420058 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.76■■□□□ 1.87
NFE4-201ENST00000420058 ARHGEF11O15085 1522 aa26.68■■□□□ 1.86
NFE4-201ENST00000420058 ABCC8Q09428 1581 aa26.67■■□□□ 1.86
NFE4-201ENST00000420058 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.85
NFE4-201ENST00000420058 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.63■■□□□ 1.85
NFE4-201ENST00000420058 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
NFE4-201ENST00000420058 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
NFE4-201ENST00000420058 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.57■■□□□ 1.84
NFE4-201ENST00000420058 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
NFE4-201ENST00000420058 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.47■■□□□ 1.83
NFE4-201ENST00000420058 FBLN2P98095 1184 aa26.46■■□□□ 1.83
NFE4-201ENST00000420058 CHD1O14646 1710 aa26.45■■□□□ 1.83
NFE4-201ENST00000420058 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
NFE4-201ENST00000420058 ARAP1Q96P48 1450 aa26.42■■□□□ 1.82
NFE4-201ENST00000420058 SOGA1O94964 1423 aa26.41■■□□□ 1.82
NFE4-201ENST00000420058 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.3■■□□□ 1.8
NFE4-201ENST00000420058 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
NFE4-201ENST00000420058 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.28■■□□□ 1.8
NFE4-201ENST00000420058 CUX1P39880 1505 aa26.25■■□□□ 1.79
NFE4-201ENST00000420058 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
NFE4-201ENST00000420058 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.23■■□□□ 1.79
NFE4-201ENST00000420058 WDR97A6NE52 1622 aa26.19■■□□□ 1.78
NFE4-201ENST00000420058 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
NFE4-201ENST00000420058 GRIN2BQ13224 1484 aa26.17■■□□□ 1.78
NFE4-201ENST00000420058 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
NFE4-201ENST00000420058 SYNJ2O15056 1496 aa26.11■■□□□ 1.77
NFE4-201ENST00000420058 SYNJ1O43426 1573 aa26.1■■□□□ 1.77
NFE4-201ENST00000420058 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.05■■□□□ 1.76
NFE4-201ENST00000420058 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.99■■□□□ 1.75
NFE4-201ENST00000420058 PBRM1Q86U86 1689 aa25.94■■□□□ 1.74
NFE4-201ENST00000420058 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.93■■□□□ 1.74
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NFE4-201ENST00000420058 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.85■■□□□ 1.73
NFE4-201ENST00000420058 GRIN2AQ12879 1464 aa25.84■■□□□ 1.73
NFE4-201ENST00000420058 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
NFE4-201ENST00000420058 NUP160Q12769 1436 aa25.8■■□□□ 1.72
NFE4-201ENST00000420058 CEP170Q5SW79 1584 aa25.76■■□□□ 1.71
NFE4-201ENST00000420058 ADAMTS12P58397 1594 aa25.74■■□□□ 1.71
NFE4-201ENST00000420058 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.71■■□□□ 1.71
NFE4-201ENST00000420058 TOP2BQ02880 1626 aa25.7■■□□□ 1.71
NFE4-201ENST00000420058 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.68■■□□□ 1.7
NFE4-201ENST00000420058 SHROOM2Q13796 1616 aa25.66■■□□□ 1.7
NFE4-201ENST00000420058 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.62■■□□□ 1.69
NFE4-201ENST00000420058 JPH4Q96JJ6 628 aa25.59■■□□□ 1.69
NFE4-201ENST00000420058 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
NFE4-201ENST00000420058 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.44■■□□□ 1.66
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