RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460976.5

CTBP2-206, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 5

Gene CTBP2, Length 603 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-206	ENST00000460976	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		65.45	■■■■■ 8.07
CTBP2-206	ENST00000460976	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		58.63	■■■■■ 6.98
CTBP2-206	ENST00000460976	ABCC9	O60706	1549 aa		57.99	■■■■■ 6.87
CTBP2-206	ENST00000460976	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		55.51	■■■■■ 6.48
CTBP2-206	ENST00000460976	NACAD	O15069	1562 aa		55.24	■■■■■ 6.43
CTBP2-206	ENST00000460976	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		54.91	■■■■■ 6.38
CTBP2-206	ENST00000460976	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		54.65	■■■■■ 6.34
CTBP2-206	ENST00000460976	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	54.37	■■■■■ 6.29
CTBP2-206	ENST00000460976	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		54.32	■■■■■ 6.29
CTBP2-206	ENST00000460976	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		54.14	■■■■■ 6.26
CTBP2-206	ENST00000460976	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	54	■■■■■ 6.24
CTBP2-206	ENST00000460976	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		53.85	■■■■■ 6.21
CTBP2-206	ENST00000460976	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		53.83	■■■■■ 6.21
CTBP2-206	ENST00000460976	SCRIB	Q14160	1630 aa		53.37	■■■■■ 6.13
CTBP2-206	ENST00000460976	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		53.22	■■■■■ 6.11
CTBP2-206	ENST00000460976	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	52.48	■■■■■ 5.99
CTBP2-206	ENST00000460976	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		52.47	■■■■■ 5.99
CTBP2-206	ENST00000460976	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		52.2	■■■■■ 5.95
CTBP2-206	ENST00000460976	SMARCA4	P51532	1647 aa		50.99	■■■■■ 5.75
CTBP2-206	ENST00000460976	NCAPD3	P42695	1498 aa		50.94	■■■■■ 5.75
CTBP2-206	ENST00000460976	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		50.85	■■■■■ 5.73
CTBP2-206	ENST00000460976	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	50.81	■■■■■ 5.72
CTBP2-206	ENST00000460976	SMARCA2	P51531	1590 aa		50.8	■■■■■ 5.72
CTBP2-206	ENST00000460976	HMGXB3	Q12766	1538 aa		50.67	■■■■■ 5.7
CTBP2-206	ENST00000460976	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		50.5	■■■■■ 5.67
CTBP2-206	ENST00000460976	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		50.43	■■■■■ 5.66
CTBP2-206	ENST00000460976	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	50.41	■■■■■ 5.66
CTBP2-206	ENST00000460976	ERCC6	Q03468	1493 aa		50.06	■■■■■ 5.6
CTBP2-206	ENST00000460976	NES	P48681	1621 aa		49.96	■■■■■ 5.59
CTBP2-206	ENST00000460976	WIZ	O95785	1651 aa		49.88	■■■■■ 5.58
CTBP2-206	ENST00000460976	CUX2	O14529	1486 aa		49.82	■■■■■ 5.57
CTBP2-206	ENST00000460976	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		49.78	■■■■■ 5.56
CTBP2-206	ENST00000460976	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	49.53	■■■■■ 5.52
CTBP2-206	ENST00000460976	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		49.44	■■■■■ 5.5
CTBP2-206	ENST00000460976	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	49.44	■■■■■ 5.5
CTBP2-206	ENST00000460976	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		49.41	■■■■■ 5.5
CTBP2-206	ENST00000460976	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		49.4	■■■■■ 5.5
CTBP2-206	ENST00000460976	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	49.3	■■■■■ 5.48
CTBP2-206	ENST00000460976	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		49.11	■■■■■ 5.45
CTBP2-206	ENST00000460976	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		48.98	■■■■■ 5.43
CTBP2-206	ENST00000460976	CFTR	P13569	1480 aa		48.96	■■■■■ 5.43
CTBP2-206	ENST00000460976	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		48.89	■■■■■ 5.42
CTBP2-206	ENST00000460976	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		48.86	■■■■■ 5.41
CTBP2-206	ENST00000460976	WDR62	O43379	1518 aa		48.86	■■■■■ 5.41
CTBP2-206	ENST00000460976	PRDM2	Q13029	1718 aa		48.69	■■■■■ 5.39
CTBP2-206	ENST00000460976	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		48.67	■■■■■ 5.38
CTBP2-206	ENST00000460976	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	48.42	■■■■■ 5.34
CTBP2-206	ENST00000460976	TOPBP1	Q92547	1522 aa		48.01	■■■■■ 5.28
CTBP2-206	ENST00000460976	ABCC8	Q09428	1581 aa		47.96	■■■■■ 5.27
CTBP2-206	ENST00000460976	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		47.92	■■■■■ 5.26
CTBP2-206	ENST00000460976	IFT140	Q96RY7	1462 aa		47.89	■■■■■ 5.26
CTBP2-206	ENST00000460976	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	47.71	■■■■■ 5.23
CTBP2-206	ENST00000460976	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	47.67	■■■■■ 5.22
CTBP2-206	ENST00000460976	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	47.57	■■■■■ 5.21
CTBP2-206	ENST00000460976	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	47.57	■■■■■ 5.21
CTBP2-206	ENST00000460976	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		47.55	■■■■■ 5.2
CTBP2-206	ENST00000460976	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	47.54	■■■■■ 5.2
CTBP2-206	ENST00000460976	CUX1	P39880	1505 aa		47.35	■■■■■ 5.17
CTBP2-206	ENST00000460976	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	47.33	■■■■■ 5.17
CTBP2-206	ENST00000460976	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		47.33	■■■■■ 5.17
CTBP2-206	ENST00000460976	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		47.33	■■■■■ 5.17
CTBP2-206	ENST00000460976	SOGA1	O94964	1423 aa		47.3	■■■■■ 5.16
CTBP2-206	ENST00000460976	WDR97	A6NE52	1622 aa		47.18	■■■■■ 5.14
CTBP2-206	ENST00000460976	TRIM41	Q8WV44	630 aa		47.17	■■■■■ 5.14
CTBP2-206	ENST00000460976	CHD1	O14646	1710 aa		47.16	■■■■■ 5.14
CTBP2-206	ENST00000460976	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	47.11	■■■■■ 5.13
CTBP2-206	ENST00000460976	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		46.97	■■■■■ 5.11
CTBP2-206	ENST00000460976	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		46.97	■■■■■ 5.11
CTBP2-206	ENST00000460976	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		46.97	■■■■■ 5.11
CTBP2-206	ENST00000460976	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		46.92	■■■■■ 5.1
CTBP2-206	ENST00000460976	FBLN2	P98095	1184 aa		46.9	■■■■■ 5.1
CTBP2-206	ENST00000460976	GRIN2B	Q13224	1484 aa		46.87	■■■■■ 5.09
CTBP2-206	ENST00000460976	ARHGEF11	O15085	1522 aa		46.85	■■■■■ 5.09
CTBP2-206	ENST00000460976	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	46.84	■■■■■ 5.09
CTBP2-206	ENST00000460976	PBRM1	Q86U86	1689 aa		46.82	■■■■■ 5.09
CTBP2-206	ENST00000460976	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		46.82	■■■■■ 5.09
CTBP2-206	ENST00000460976	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		46.81	■■■■■ 5.08
CTBP2-206	ENST00000460976	TOP2B	Q02880	1626 aa		46.77	■■■■■ 5.08
CTBP2-206	ENST00000460976	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		46.76	■■■■■ 5.08
CTBP2-206	ENST00000460976	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		46.76	■■■■■ 5.08
CTBP2-206	ENST00000460976	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	46.75	■■■■■ 5.07	5e-6	■■■□□ 14.6
CTBP2-206	ENST00000460976	SYNJ1	O43426	1573 aa		46.71	■■■■■ 5.07
CTBP2-206	ENST00000460976	SYNJ2	O15056	1496 aa		46.66	■■■■■ 5.06
CTBP2-206	ENST00000460976	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	46.66	■■■■■ 5.06
CTBP2-206	ENST00000460976	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		46.57	■■■■■ 5.05
CTBP2-206	ENST00000460976	ARAP1	Q96P48	1450 aa		46.41	■■■■■ 5.02
CTBP2-206	ENST00000460976	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		46.38	■■■■■ 5.02
CTBP2-206	ENST00000460976	ADAMTS12	P58397	1594 aa		46.35	■■■■■ 5.01
CTBP2-206	ENST00000460976	GRIN2A	Q12879	1464 aa		46.28	■■■■■ 5
CTBP2-206	ENST00000460976	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		46.27	■■■■■ 5
CTBP2-206	ENST00000460976	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		46.2	■■■■■ 4.99
CTBP2-206	ENST00000460976	CEP170	Q5SW79	1584 aa		46.1	■■■■■ 4.97
CTBP2-206	ENST00000460976	NUP160	Q12769	1436 aa		46.09	■■■■■ 4.97
CTBP2-206	ENST00000460976	SHROOM2	Q13796	1616 aa		45.89	■■■■■ 4.94
CTBP2-206	ENST00000460976	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		45.84	■■■■■ 4.93
CTBP2-206	ENST00000460976	KIF27	Q86VH2	1401 aa		45.84	■■■■■ 4.93
CTBP2-206	ENST00000460976	CUL7	Q14999	1698 aa		45.75	■■■■■ 4.91
CTBP2-206	ENST00000460976	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	45.73	■■■■■ 4.91
CTBP2-206	ENST00000460976	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		45.7	■■■■■ 4.91
CTBP2-206	ENST00000460976	IGF1R	P08069	1367 aa		45.7	■■■■■ 4.91

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