Protein–RNA interactions for Protein: Q6EKJ0

GTF2IRD2B, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms