Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E4F1Q66K89 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
E4F1Q66K89 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
E4F1Q66K89 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms