Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLIPQ5VWP3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MLIPQ5VWP3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms