Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GARNL3Q5VVW2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GARNL3Q5VVW2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GARNL3Q5VVW2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GARNL3Q5VVW2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms