Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGSNQ5TDP6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LGSNQ5TDP6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGSNQ5TDP6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.6 ms