Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RSPH4AQ5TD94 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RSPH4AQ5TD94 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
RSPH4AQ5TD94 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
RSPH4AQ5TD94 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
RSPH4AQ5TD94 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
RSPH4AQ5TD94 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RSPH4AQ5TD94 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RSPH4AQ5TD94 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RSPH4AQ5TD94 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RSPH4AQ5TD94 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RSPH4AQ5TD94 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RSPH4AQ5TD94 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RSPH4AQ5TD94 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RSPH4AQ5TD94 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RSPH4AQ5TD94 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
RSPH4AQ5TD94 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms