Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFYVE27Q5T4F4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZFYVE27Q5T4F4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZFYVE27Q5T4F4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms