Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUD3Q5T2D3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD3Q5T2D3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms