Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FBXO47Q5MNV8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FBXO47Q5MNV8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FBXO47Q5MNV8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FBXO47Q5MNV8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FBXO47Q5MNV8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FBXO47Q5MNV8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FBXO47Q5MNV8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO47Q5MNV8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO47Q5MNV8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FBXO47Q5MNV8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FBXO47Q5MNV8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FBXO47Q5MNV8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FBXO47Q5MNV8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXO47Q5MNV8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXO47Q5MNV8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXO47Q5MNV8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXO47Q5MNV8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXO47Q5MNV8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXO47Q5MNV8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO47Q5MNV8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO47Q5MNV8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO47Q5MNV8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO47Q5MNV8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO47Q5MNV8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO47Q5MNV8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO47Q5MNV8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO47Q5MNV8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FBXO47Q5MNV8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FBXO47Q5MNV8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FBXO47Q5MNV8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXO47Q5MNV8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO47Q5MNV8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXO47Q5MNV8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms