Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC158Q5M9N0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC158Q5M9N0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC158Q5M9N0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC158Q5M9N0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC158Q5M9N0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC158Q5M9N0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC158Q5M9N0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC158Q5M9N0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC158Q5M9N0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC158Q5M9N0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC158Q5M9N0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC158Q5M9N0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.2 ms