Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPECC1Q5M775 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPECC1Q5M775 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPECC1Q5M775 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPECC1Q5M775 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPECC1Q5M775 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SPECC1Q5M775 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPECC1Q5M775 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPECC1Q5M775 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPECC1Q5M775 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPECC1Q5M775 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPECC1Q5M775 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPECC1Q5M775 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPECC1Q5M775 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPECC1Q5M775 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPECC1Q5M775 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPECC1Q5M775 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPECC1Q5M775 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPECC1Q5M775 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SPECC1Q5M775 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SPECC1Q5M775 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPECC1Q5M775 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPECC1Q5M775 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SPECC1Q5M775 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms