Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COBLL1Q53SF7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
COBLL1Q53SF7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COBLL1Q53SF7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms