Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
KRTAP21-1Q3LI58 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms