Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
COL24A1Q17RW2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
COL24A1Q17RW2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
COL24A1Q17RW2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
COL24A1Q17RW2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
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