Protein–RNA interactions for Protein: Q16829

DUSP7, Dual specificity protein phosphatase 7, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP7Q16829 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP7Q16829 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP7Q16829 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP7Q16829 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP7Q16829 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP7Q16829 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP7Q16829 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP7Q16829 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP7Q16829 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP7Q16829 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP7Q16829 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP7Q16829 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP7Q16829 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP7Q16829 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP7Q16829 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP7Q16829 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP7Q16829 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP7Q16829 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP7Q16829 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP7Q16829 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP7Q16829 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP7Q16829 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms