Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
R3HDM1Q15032 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
R3HDM1Q15032 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
R3HDM1Q15032 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
R3HDM1Q15032 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
R3HDM1Q15032 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
R3HDM1Q15032 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC31.23■■■□□ 2.59
R3HDM1Q15032 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
R3HDM1Q15032 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
R3HDM1Q15032 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
R3HDM1Q15032 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
R3HDM1Q15032 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
R3HDM1Q15032 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
R3HDM1Q15032 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
R3HDM1Q15032 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
R3HDM1Q15032 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
R3HDM1Q15032 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
R3HDM1Q15032 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
R3HDM1Q15032 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
R3HDM1Q15032 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
R3HDM1Q15032 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
R3HDM1Q15032 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
R3HDM1Q15032 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
R3HDM1Q15032 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
R3HDM1Q15032 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
R3HDM1Q15032 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
R3HDM1Q15032 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
R3HDM1Q15032 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
R3HDM1Q15032 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
R3HDM1Q15032 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
R3HDM1Q15032 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
R3HDM1Q15032 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
R3HDM1Q15032 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
R3HDM1Q15032 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
R3HDM1Q15032 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
R3HDM1Q15032 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
R3HDM1Q15032 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
R3HDM1Q15032 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
R3HDM1Q15032 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
R3HDM1Q15032 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
R3HDM1Q15032 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
R3HDM1Q15032 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
R3HDM1Q15032 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
R3HDM1Q15032 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
R3HDM1Q15032 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
R3HDM1Q15032 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
R3HDM1Q15032 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
R3HDM1Q15032 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
R3HDM1Q15032 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
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