Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPNMBQ14956 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPNMBQ14956 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 284.8 ms