Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PTCH1Q13635 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTCH1Q13635 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTCH1Q13635 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTCH1Q13635 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTCH1Q13635 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTCH1Q13635 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTCH1Q13635 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTCH1Q13635 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTCH1Q13635 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTCH1Q13635 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTCH1Q13635 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTCH1Q13635 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTCH1Q13635 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTCH1Q13635 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTCH1Q13635 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTCH1Q13635 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTCH1Q13635 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTCH1Q13635 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTCH1Q13635 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTCH1Q13635 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTCH1Q13635 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PTCH1Q13635 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PTCH1Q13635 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTCH1Q13635 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTCH1Q13635 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTCH1Q13635 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
PTCH1Q13635 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTCH1Q13635 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTCH1Q13635 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTCH1Q13635 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTCH1Q13635 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTCH1Q13635 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTCH1Q13635 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTCH1Q13635 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTCH1Q13635 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTCH1Q13635 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTCH1Q13635 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTCH1Q13635 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
PTCH1Q13635 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTCH1Q13635 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTCH1Q13635 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTCH1Q13635 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTCH1Q13635 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTCH1Q13635 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTCH1Q13635 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PTCH1Q13635 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PTCH1Q13635 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PTCH1Q13635 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
PTCH1Q13635 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
PTCH1Q13635 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PTCH1Q13635 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
PTCH1Q13635 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
PTCH1Q13635 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PTCH1Q13635 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTCH1Q13635 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTCH1Q13635 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
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