Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF4BQ13523 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF4BQ13523 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF4BQ13523 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
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