Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NFIAQ12857 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NFIAQ12857 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFIAQ12857 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFIAQ12857 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFIAQ12857 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFIAQ12857 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFIAQ12857 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NFIAQ12857 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NFIAQ12857 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFIAQ12857 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFIAQ12857 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFIAQ12857 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFIAQ12857 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFIAQ12857 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFIAQ12857 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFIAQ12857 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFIAQ12857 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFIAQ12857 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFIAQ12857 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFIAQ12857 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFIAQ12857 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NFIAQ12857 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFIAQ12857 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFIAQ12857 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
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