Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH3

ACSM2A, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2AQ08AH3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSM2AQ08AH3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACSM2AQ08AH3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSM2AQ08AH3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSM2AQ08AH3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSM2AQ08AH3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSM2AQ08AH3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSM2AQ08AH3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSM2AQ08AH3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSM2AQ08AH3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSM2AQ08AH3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSM2AQ08AH3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSM2AQ08AH3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSM2AQ08AH3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSM2AQ08AH3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSM2AQ08AH3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSM2AQ08AH3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSM2AQ08AH3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSM2AQ08AH3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSM2AQ08AH3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSM2AQ08AH3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSM2AQ08AH3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSM2AQ08AH3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSM2AQ08AH3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 311.9 ms