Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFRSF9Q07011 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms