Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB2Q03252 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNB2Q03252 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNB2Q03252 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms