Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SP3Q02447 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SP3Q02447 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SP3Q02447 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SP3Q02447 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SP3Q02447 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SP3Q02447 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SP3Q02447 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SP3Q02447 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SP3Q02447 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SP3Q02447 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SP3Q02447 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SP3Q02447 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SP3Q02447 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SP3Q02447 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SP3Q02447 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SP3Q02447 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SP3Q02447 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SP3Q02447 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SP3Q02447 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SP3Q02447 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SP3Q02447 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SP3Q02447 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SP3Q02447 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SP3Q02447 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SP3Q02447 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SP3Q02447 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SP3Q02447 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SP3Q02447 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SP3Q02447 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SP3Q02447 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SP3Q02447 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SP3Q02447 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SP3Q02447 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SP3Q02447 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SP3Q02447 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SP3Q02447 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SP3Q02447 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SP3Q02447 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SP3Q02447 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SP3Q02447 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SP3Q02447 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SP3Q02447 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SP3Q02447 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SP3Q02447 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SP3Q02447 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SP3Q02447 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SP3Q02447 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SP3Q02447 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SP3Q02447 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SP3Q02447 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SP3Q02447 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SP3Q02447 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SP3Q02447 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SP3Q02447 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SP3Q02447 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SP3Q02447 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SP3Q02447 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SP3Q02447 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SP3Q02447 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SP3Q02447 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SP3Q02447 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SP3Q02447 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SP3Q02447 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SP3Q02447 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SP3Q02447 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SP3Q02447 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SP3Q02447 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SP3Q02447 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SP3Q02447 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SP3Q02447 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SP3Q02447 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SP3Q02447 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SP3Q02447 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SP3Q02447 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SP3Q02447 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SP3Q02447 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SP3Q02447 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SP3Q02447 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SP3Q02447 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SP3Q02447 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SP3Q02447 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SP3Q02447 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SP3Q02447 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SP3Q02447 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SP3Q02447 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SP3Q02447 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SP3Q02447 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SP3Q02447 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SP3Q02447 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP3Q02447 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP3Q02447 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP3Q02447 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP3Q02447 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP3Q02447 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP3Q02447 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP3Q02447 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SP3Q02447 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP3Q02447 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP3Q02447 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms