Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTUD4Q01804 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD4Q01804 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
OTUD4Q01804 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUD4Q01804 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUD4Q01804 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUD4Q01804 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD4Q01804 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD4Q01804 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUD4Q01804 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUD4Q01804 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD4Q01804 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD4Q01804 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD4Q01804 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD4Q01804 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD4Q01804 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD4Q01804 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTUD4Q01804 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms