Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAP1Q01518 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAP1Q01518 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAP1Q01518 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.9 ms